若按武书连版排行榜看，上海中医药大学2021年全国排名第175位，在上海排名第12位；2020年全国排名第166位，在上海排名第12位；2019年全国排名第165位，在上海排名第12位。以下是上海中医药大学历年排名整理表：
上海中医药大学 排名（最新）
双一流(2)
上海中医药大学排行榜之武书连版
| 年份 | 排名 | 所在地排名 | 类型 | 参考类型1 | 参考类型2 |
|---|---|---|---|---|---|
| 2021 | 175 上海中医药大学 | 上海（12） | 医药 | 医学类 | 研教2型 |
| 2020 | 166 上海中医药大学 | 上海（12） | 医药 | 医学类 | 研教2型 |
| 2019 | 165 上海中医药大学 | 上海（12） | 医药 | 医学类 | 研教2型 |
| 2018 | 179 上海中医药大学 | 上海（13） | 医药 | 医学类 | 研教2型 |
| 2017 | 172 上海中医药大学 | 上海（11） | 医药 | 医学类 | 研教2型 |
| 2016 | 177 上海中医药大学 | 上海（12） | 医药 | 医学类 | 研教2型 |
| 2015 | 197 上海中医药大学 | 上海（13） | 医药 | 医学类 | 研教2型 |
| 2014 | 202 上海中医药大学 | 上海（13） | 医药 | 医学类 | 研教2型 |
| 2013 | 186 上海中医药大学 | 上海（13） | 医药 | 医学类 | 研教1型 |
| 2012 | 180 上海中医药大学 | 上海（13） | 医药 | 医学类 | 研教1型 |
上海中医药大学排行榜之校友会版
若按校友会版大学排行榜看，上海中医药大学2023年全国排名第112位；2022年全国排名第110位；2021年全国排名第113位。以下是上海中医药大学历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 星级 | 所在地 | 类型 | 办学类型 | 办学层次 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2023 | 112 上海中医药大学 | 6 | 上海 | 医药 | - | 世界高水平大学 |
| 2022 | 110 上海中医药大学 | 6 | 上海 | 医药 | - | 世界高水平大学 |
| 2021 | 113 上海中医药大学 | 6 | 上海 | 医药 | - | 世界高水平大学 |
| 2020 | 115 上海中医药大学 | 6 | 上海 | 医药 | 研究型 | 世界高水平大学 |
| 2019 | 157 上海中医药大学 | 6 | 上海 | 医药 | 特色型-中医药类 研究型 |
世界高水平大学(特色) |
| 2018 | 134 上海中医药大学 | 5 | 上海 | 医药 | 特色研究型 | 世界知名、中国一流大学 |
| 2017 | 150 上海中医药大学 | 4 | 上海 | 医药 | 区域特色研究型 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 2016 | 162 上海中医药大学 | 4 | 上海 | 医药 | 区域特色研究型 | 中国高水平大学 |
| 2015 | 157 上海中医药大学 | 4 | 上海 | 医药 | 区域特色研究型 | 中国高水平大学 |
| 2014 | 137 上海中医药大学 | 4 | 上海 | 医药 | 专业型 | 中国高水平大学 |
| 2013 | 150 上海中医药大学 | 上海 | 医药 | - | ||
| 2012 | 140 上海中医药大学 | 上海 | 医药 | - | ||
| 2011 | 140 上海中医药大学 | 上海 | 医药 | - | ||
| 2010 | 136 上海中医药大学 | 上海 | 医药 | - |
上海中医药大学排行榜之最好大学版
若按最好大学版排行榜看，上海中医药大学2019年综合实力排名第8位；2018年综合实力排名第83位；2017年综合实力排名第103位。以下是上海中医药大学综合实力排名表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 所在地 | 新生高考成绩得分 | 毕业生就业率 |
|---|---|---|---|---|---|
| 2019 | 8 医 | 上海中医药大学 | 上海 | 58.1 | 97.21% |
| 2018 | 83 | 上海中医药大学 | 上海 | 58.2 | 97.48% |
| 2017 | 103 | 上海中医药大学 | 上海 | 53.7 | 96.58% |
| 2016 | 114 | 上海中医药大学 | 上海 | 57.5 | 95.27% |
| 2015 | 117 | 上海中医药大学 | 上海 | 52.2 | 95.27% |
上海中医药大学排行榜之金平果版
若按金平果版本科院校排行榜看，上海中医药大学2023年全国排名第202位；2022年全国排名第173位；2021年全国排名第154位。以下是上海中医药大学历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 所在地排名 |
|---|---|---|
| 2023 | 202 上海中医药大学 | 上海（11） |
| 2022 | 173 上海中医药大学 | 上海（12） |
| 2021 | 154 上海中医药大学 | 上海（12） |
| 2020 | 135 上海中医药大学 | 上海（10） |
| 2019 | 123 上海中医药大学 | 上海（10） |
| 2018 | 108 上海中医药大学 | 上海（10） |
| 2017 | 91 上海中医药大学 | 上海（9） |
| 2016 | 87 上海中医药大学 | 上海（9） |
| 2015 | 81 上海中医药大学 | 上海（9） |
